第六届科博会2003年9月12日-15日在京举办。虽受非典影响而延期，但活动规模、及影响都超出预期。来自45个国家和地区的85个外国政府、科技企业代表团组参加了展览、洽谈、论坛及专项交流活动。全国31个省、自治区、直辖市和港澳台地区组成以政府和企业界为主的代表团首次齐聚科博会，全面参与活动。

本届科博会主题是“科技创新、奥运经济、社会发展”，按照“突出主题，打造精品”策划原则，总体规模进行了适当控制，呈现专业化展览集成特色，突出展示了高新技术在奥运组织和建设中的应用，在振兴现代制造业中的应用，在百姓生活中的应用及在城市建设和社会发展中的应用。其中数字奥运技术及装备展、科技奥运展，汇集了国内外IT业顶级企业的最新电子信息通讯技术，展示了2008奥运会将给经济社会发展带来的科技合作商机。

科博会举办22个论坛和专项活动，国际知名科学家、世界500强企业首脑、金融家、知名专家学者等500多人发表演讲，闭幕前进行的“产业政策部长论坛”，科技部部长徐冠华、信息产业部部长王旭东、商务部副部长于广洲、教育部副部长章新胜在演讲中，向中外嘉宾介绍了中国新一届政府在高新技术各相关产业的发展规划和趋势。“科博会”举办以技术引进、招商引资以及政府采购、奥运建设与产品市场开发推介、传统产业改造、中小企业科技创新、农业科技项目推广等为内容的六场经贸洽谈活动。

“科博会”期间，共签定以高新技术为主的合资合作项目、技术交易项目224个，协议总金额46.82亿美元。